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限制性内切酶常识

关于限制性内切酶使用的一些常识(什么是同尾酶?)
 

如何保存限制性内切酶

不太常用的限制性内切酶多保存在-70oC,每周或每天用的酶保存在-20 oC。有一些酶需要不同的保存条件。使用限制性内切酶时,应将酶保存在冰上。

一般的限制性内切酶反应中(也叫消化),应用多少内切酶

所用的酶量取决于DNA的纯度、量和型态。限制性内切酶的活力单位定义为在适当的温度下,在1小时内,1ugDNA在50ul体积中,被完全消化所 需的限制性内切酶的量。一般说来,线性DNA比超螺旋DNA更易消化。比如,酶切1uglambdaDNA,需要1-2单位的酶,而酶切1ug质粒 DNA,需要3-5单位的酶。

使用限制性内切酶的一般步骤是什么

一般步骤如下:
A)测试酶切DNA的量
B)计算完全酶切所需的酶量。为使终体积中甘油的浓度低于8%,计算能加的酶量,最多能加终体积的10%(甘油的浓度为5%)。
C)10X反应液的体积应为终体积的1/10;10X反应液的体积不应小于酶的体积。
D)加入计算好的DNA,10X反应液,酶。
加入水到终体积(20-50 ul),轻轻混匀,在适当的温度下保温。一般酶的最适温度为37 oC,但有例外。应查讯分析说明。


比如:
质粒DNA (2ug/ ul) 5 ul
10X反应液 5 ul
酶(5ug/ ul) 5 ul
dH2O 35 ul
50 ul
37 ℃保温2-3小时。


应最后加酶


能否在一次反应中用很多的限制性内切酶?

可以,一般而言,甘油浓度超过8%对酶切有抑制。有些酶在高的甘油浓度中会产生星活力。限制性内切酶提供在50%的甘油中,故10 ul反应体积中不应加入超过1.6 ul的酶。

消化反应中是否需要加牛血清白蛋白(BSA)?

不需要。酶切不需要加BSA。但Promega公司的限制性内切酶活力测定时,均加入乙酰化的BSA达0.1mg/ml。BSA可以提高许多限制性 内切酶活力。Promega公司的限制性内切酶均提供一管乙酰化的BSA(R396D,E,F),并建议酶切时加入BSA达0.1mg/ml。

星活力是什么?

星活力是指在保温条件改变,如NaCl过多存在于反应液中,使酶切的核酸序列不同于它特定的识别序列。

什么是同切酶?

同切酶指两个酶的识别位点和酶切位点相同,如SphI(CGTAC'G)和BbuI(CGTAC'G)互为同切酶。

什么是neoschizomer?

Neoschizomer指两个酶的识别序列相同,但酶切位点不同,如SmaI(GGG'CCC)和XmaI(G'GGCCC)互为neoschizomer。

什么是蓝/白克隆测试?

蓝/白克隆测试是一种确定酶切样品中,存在的少量外切核酸酶活力的质量检查过程。通过测定一个功能基因(Beta-半乳糖苷酶)酶切和重新连接后, 蓝/白斑的比例,来确定外切核酸酶活力。如果存在少量外切核酸酶活力,或不存在外切核酸酶活力,得到的是蓝色菌落。产生粘性末端的酶实验产生的白色菌落应 小于2%,而产生平头末端的酶实验产生的白色菌落应小于5%。这个方法的灵敏度很高,可以检测出缺失一个碱基的酶切末端。

限制性内切酶是如何命名的?

限制性内切酶命名的次序如下:
A) 用3个字母代表来源的生物(如Bam代表 Bacillus amyloliquefaciens)
B) 1个字母或阿拉伯数字代表菌株(BamH)
C) 1个罗马字母代表发现或鉴定的次序(BamHI)

如何稀释限制性内切酶?

如果1小时内会使用限制性内切酶,可用补充有0.5mg/ml BSA的1X反应液稀释,如果在更长的时间内才会使用限制性内切酶,用酶贮存液稀释。

以上资料摘自Promega网站。

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